Bio Model Analyzer是一款微軟基于云的生理學(xué)研究工具，可以用于對化細胞交互和通信進行建模，現(xiàn)已經(jīng)在GitHub上開源，在MIT許可之下。

研究人員使用Bio Model Analyzer (BMA) 去創(chuàng)建計算機模型，該模型可以比較健康和不健康細胞內(nèi)的處理。研究人員可以在一個畫布之上拖曳細胞及其它們的上下文（比如DNA或蛋白質(zhì)）以及細胞外的組件。他們還可以繪制這些組件之間的關(guān)系。為了測試和確認生命系統(tǒng)的行為，或者調(diào)查生理系統(tǒng)有怎樣的穩(wěn)定性，可以對這些模型進行驗證、修訂，以及重新驗證。

BMA合并了系統(tǒng)生理學(xué)和形式化方法，其中形式化方法已被用于并發(fā)軟件系統(tǒng)的描述和驗證。就像CAD/CAM用于工程開發(fā)一樣，BMA使用人機交互和設(shè)計去加速藥物相互作用和抗藥性之類領(lǐng)域的研究。“我們正在嘗試去改變生理學(xué)日常研究的工作方式，”Jasmin Fisher說，他是一名訓(xùn)練有素的生理學(xué)家，就職于微軟英國劍橋?qū)嶒炇业木幊淘砗凸ぞ咝〗M。

BMA模型可以使科學(xué)家看到成千上萬個基因和蛋白質(zhì)的相互使用。Ben Hall 是一名英國劍橋大學(xué)的皇家學(xué)會大學(xué)研究員，他和Fisher在一起共事。他說，BMA可以用于幫助找出盡早地檢測出癌癥的方式。它還可以通過建模來理解如何更好地治療癌癥，對哪些藥物將更有效，以及什么時候特定的癌癥可能會產(chǎn)生抗藥性進行建模。

BMA用于進行比較來自于健康病人和癌癥病人的信息的實驗。它可以模擬病人會對藥物作出怎樣的反應(yīng)。這有許多的變量，在人體中有許多的分子、蛋白質(zhì)以及基因。只有強大的計算模型才能對這些組合進行分類，以及尋找異常情況、試驗可能性、理解癌癥是如何在體內(nèi)形成和變異的。

“我認為它將加快研究的速度，因為我們可以試驗非常多的可能性，這遠遠高于在實驗室可試驗的可能性，”Jonathan Dry說。他是AstraZeneca 制藥公司的首席科學(xué)家，他的團隊正在與Fisher的團隊合作。研究人員將不必再進行有根據(jù)的推測了，而是可以基于自己的傾向大膽假設(shè)。

BMA使為病人提供個性化的癌癥治療成為可能。單獨一個人可能有其他疾病，或者正在服用可能與處方有相互影響的藥物。這些都可以放進模型里。“你不得不承認，每個病人都是一個單獨的個體，有著非常廣泛的異質(zhì)性，”Dry說。

查看英文原文：Microsoft Makes Cloud-Based Biological Research Tool Open Source