摘要 : 二者不是誰(shuí)打敗誰(shuí)。沒(méi)有超算完成大規(guī)模的基礎(chǔ)科學(xué)研究和計(jì)算密集型的工作,云計(jì)算也不可能給合作伙伴和用戶交付有價(jià)值的東西。
在上周五(12月12日)召開的2014年度亞馬遜AWS技術(shù)峰會(huì)上,華大科技副總裁陳鋼上臺(tái)為AWS做證言稱,由于廣州和天津兩大超算中心并不完全針對(duì)to C業(yè)務(wù),而且沒(méi)有本地存儲(chǔ),所以華大正在往云平臺(tái)上遷移。陳鋼的證言,被業(yè)內(nèi)解讀為華大基因正在拋棄高性能計(jì)算。
今日,華大科技方面專程通過(guò)《在前線》對(duì)這一觀點(diǎn)做了反饋和澄清。
陳鋼在接受《在前線》采訪時(shí)詳細(xì)地介紹了華大科技在IT方面的布局,他指出,在高性能計(jì)算和云計(jì)算方面,華大科技有清晰的戰(zhàn)略,這兩者都占有舉足輕重的作用。
華大基因被妖魔化?
華大科技是華大基因的子公司,而華大基因是全球知名的生命科學(xué)研究機(jī)構(gòu)、全球最大的基因組學(xué)研究機(jī)構(gòu),全球頂尖的三家基因組研究機(jī)構(gòu)之一,另外兩家是美國(guó)的Broad和英國(guó)的Sanger。
近年來(lái),中國(guó)的高性能計(jì)算水平逐年提升,來(lái)自中國(guó)的超級(jí)計(jì)算機(jī)系統(tǒng)成為全球超級(jí)計(jì)算機(jī)TOP 500排行榜的???。
由于高性能計(jì)算多用在科研、軍事、能源、生命科學(xué)等要害部門和行業(yè)領(lǐng)域,因而各個(gè)國(guó)家都對(duì)高性能計(jì)算持續(xù)投入,近年來(lái),中國(guó)已經(jīng)成為繼美國(guó)、日本等發(fā)達(dá)國(guó)家之后冉冉升起的高性能計(jì)算領(lǐng)域新星。
陳鋼介紹說(shuō),國(guó)家對(duì)生命科學(xué)研究方面給予了大力支持。由于有國(guó)家超算中心的大力支持,華大基因在計(jì)算資源和技術(shù)支持都能夠得到很好的保證。
說(shuō)到這里,問(wèn)題來(lái)了,華大基因既然并不缺資源,為何還要使用云計(jì)算?
之所以采用云計(jì)算,一方面是基因科學(xué)領(lǐng)域的不斷發(fā)展導(dǎo)致的,另外是有具體的原因。
陳鋼解釋說(shuō),大量計(jì)算密集型的工作在超算中心和華大自己的數(shù)據(jù)中心完成后,需要將結(jié)果交付給合作伙伴和分支機(jī)構(gòu)。以前的做法是大量使用FTP和快遞硬盤。但是相比之下,如今云計(jì)算有著遍布各地的數(shù)據(jù)中心,顯然這是一個(gè)更好的解決方案。
另外,基因組學(xué)的科學(xué)研究成果需要大量地轉(zhuǎn)化為應(yīng)用,華大為全球用戶提供服務(wù)時(shí),自建機(jī)房顯然不是最佳選擇。因此,華大需要云計(jì)算,尤其是在海外需求更強(qiáng)烈。
陳鋼強(qiáng)調(diào)說(shuō),需要指出的是,云計(jì)算并不是要替代超算以及自己的數(shù)據(jù)中心。沒(méi)有超算完成大規(guī)模的基礎(chǔ)科學(xué)研究和計(jì)算密集型的工作,云計(jì)算也不可能給合作伙伴和用戶交付有價(jià)值的東西。
高性能計(jì)算和云計(jì)算缺一不可
據(jù)陳鋼介紹,華大基因在IT方面的需求主要來(lái)自三個(gè)方面,第一個(gè)是基礎(chǔ)研究中的大規(guī)模計(jì)算,例如大規(guī)模的腸道菌群宏基因組研究,計(jì)算量非常大,同時(shí)需要用到CPU和GPU;大規(guī)?;蚪M的組裝工作,計(jì)算復(fù)雜度高,需要不斷的探索和調(diào)整算法及算法的參數(shù),例如最近剛剛發(fā)表的鳥類基因組和進(jìn)化分析的研究成果。
這一部分需求由華大自己的數(shù)據(jù)中心和國(guó)家超算中心來(lái)滿足,其中計(jì)算密集型的項(xiàng)目大量使用國(guó)家超算中心資源。
第二方面的需求是致力于完成百萬(wàn)人類基因組項(xiàng)目所需的存儲(chǔ)和計(jì)算資源。目前滿足這方面需求的方案,還在規(guī)劃當(dāng)中。
第三方面的需求是為華大基因的全球用戶消費(fèi)者交付數(shù)據(jù)和分析結(jié)果。滿足這方面的需求,之前是使用華大位于深圳、香港、武漢的自有數(shù)據(jù)中心。目前正在向以AWS為代表的公有云遷移。
陳鋼補(bǔ)充說(shuō),“為了完成這個(gè)遷移,更重要是為了能以華大產(chǎn)生的海量基因組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)構(gòu)建起全球的基因組學(xué)研究平臺(tái),我們正在共有云上分別開發(fā)面向科學(xué)研究、臨床診斷,個(gè)人基因組等不同類型用戶的系統(tǒng)和應(yīng)用。”
陳鋼談到的這一點(diǎn),正是在AWS技術(shù)峰會(huì)上引發(fā)業(yè)界議論的結(jié)點(diǎn)所在。“我們并沒(méi)有像外界所說(shuō)的那樣,拋棄高性能計(jì)算,更沒(méi)有全面都撲到云計(jì)算上面,而是有清晰的戰(zhàn)略和布局。”
據(jù)悉,華大科技在數(shù)據(jù)交付方面,長(zhǎng)期跟AWS有業(yè)務(wù)往來(lái),但規(guī)模并不大。從去年開始,隨著華大開始構(gòu)建基于云計(jì)算的生物數(shù)據(jù)分析平臺(tái),以及AWS進(jìn)入中國(guó),其與AWS的業(yè)務(wù)開始有了大幅增長(zhǎng)。
如今,華大科技正在積極拓展海外市場(chǎng),隨著云計(jì)算生物信息平臺(tái)逐步的完善和在海外市場(chǎng)的推出,與AWS合作的業(yè)務(wù)量也在加速。
亞馬遜AWS如今是全球最大的公有云服務(wù)提供商,于2013年12月份AWS宣布在中國(guó)啟動(dòng)測(cè)試版,當(dāng)時(shí)華大基因就是AWS在中國(guó)的首批用戶。
陳鋼表示,在為華大基因服務(wù)時(shí),AWS安排了客戶經(jīng)理和技術(shù)團(tuán)隊(duì),為華大全球業(yè)務(wù)提供技術(shù)支持,從深圳、香港到加州,都可以快速地得到響應(yīng)和支持。
在本次技術(shù)峰會(huì)上,AWS發(fā)布了“AWS云創(chuàng)計(jì)劃”(AWS Activate),并攜手重慶市政府建立AWS在中國(guó)的第三個(gè)聯(lián)合孵化器。“AWS云創(chuàng)計(jì)劃”是一個(gè)全球性創(chuàng)業(yè)加速扶持計(jì)劃,可以提供的支持包括最高可達(dá)人民幣10萬(wàn)的AWS服務(wù)抵扣券、技術(shù)培訓(xùn)、創(chuàng)業(yè)公司專項(xiàng)活動(dòng)以及內(nèi)容廣泛的開發(fā)者支持。