英國(guó)建立世界最大微生物基因組云計(jì)算平臺(tái)

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2016-08-04 14:33:16

摘自:生物谷

最近英國(guó)華威大學(xué)等研究機(jī)構(gòu)的研究人員基于云技術(shù)開(kāi)發(fā)了一個(gè)目前全世界最大的微生物生物信息學(xué)平臺(tái)。來(lái)自伯明翰大學(xué)的Nick Loman也參與了CLIMB研究,他這樣說(shuō)道:“我們已經(jīng)使用CLIMB分析和分享了西非埃博拉病毒爆發(fā)的數(shù)據(jù)。

最近英國(guó)華威大學(xué)等研究機(jī)構(gòu)的研究人員基于云技術(shù)開(kāi)發(fā)了一個(gè)目前全世界最大的微生物生物信息學(xué)平臺(tái)。

這個(gè)叫做CLIMB的項(xiàng)目(Cloud Infrastructure for Microbial Bioinformatics)是屬于英國(guó)醫(yī)學(xué)微生物學(xué)團(tuán)體和相關(guān)國(guó)際合作機(jī)構(gòu)的生物信息學(xué)資源。該平臺(tái)將通過(guò)提供免費(fèi)的云計(jì)算,存儲(chǔ)和分析工具支持科學(xué)研究。

華威大學(xué)的Mark Pallen教授負(fù)責(zé)領(lǐng)導(dǎo)該項(xiàng)目,他這樣說(shuō)道:“CLIMB為學(xué)術(shù)領(lǐng)域和臨床領(lǐng)域的微生物學(xué)家和科研人員提供了軟件和數(shù)據(jù)分享的一站式服務(wù)。使用云技術(shù)就意味著全國(guó)的研究團(tuán)隊(duì)不再需要自行建立和維護(hù)自己的服務(wù)器,使用者可以根據(jù)需要獲取別人分享的計(jì)算資源。”

隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展提高,產(chǎn)生基因組數(shù)據(jù)已經(jīng)變得越來(lái)越簡(jiǎn)單。但是許多學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)仍然無(wú)法獲取他們需要的資源來(lái)進(jìn)行生物信息學(xué)分析。CLIMB平臺(tái)將為他們分享資源幫助他們完成計(jì)算分析。該研究的領(lǐng)導(dǎo)者也有計(jì)劃舉辦專(zhuān)題討論小組和會(huì)議來(lái)進(jìn)行培訓(xùn),分享知識(shí),進(jìn)一步發(fā)展微生物生物信息學(xué)團(tuán)體。

來(lái)自伯明翰大學(xué)的Nick Loman也參與了CLIMB研究,他這樣說(shuō)道:“我們已經(jīng)使用CLIMB分析和分享了西非埃博拉病毒爆發(fā)的數(shù)據(jù)。這代表了科學(xué)協(xié)作的一個(gè)巨大變化,特別是在面對(duì)公共健康緊急事件的時(shí)候。”

Pallen教授補(bǔ)充道:“我們看到CLIMB已經(jīng)不僅僅是一個(gè)學(xué)術(shù)平臺(tái),我們更希望它變成連接學(xué)術(shù)領(lǐng)域和公共健康領(lǐng)域?qū)<覀兊囊蛔鶚蛄?,使這兩個(gè)領(lǐng)域的團(tuán)體之間除了可以交換軟件和數(shù)據(jù),還會(huì)在技巧,知識(shí)和方法的分享方面變得更加便捷。”

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