全國(guó)首個(gè)生物醫(yī)療開放大數(shù)據(jù)研究中心落滬,意欲突破行業(yè)困境

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2016-03-13 21:12:06

摘自:澎湃新聞網(wǎng)

原標(biāo)題:全國(guó)首個(gè)生物醫(yī)療開放大數(shù)據(jù)研究中心落滬,意欲突破行業(yè)困境 據(jù)介紹,華理-梅斯生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)研究中心將從開放鏈接大數(shù)據(jù)和專注多元化開發(fā)模式等方面為進(jìn)一步推動(dòng)生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)的發(fā)展作出貢獻(xiàn)。

  華理-梅斯生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)研究中心成立儀式

互聯(lián)網(wǎng)+時(shí)代,大數(shù)據(jù)被認(rèn)為是改變行業(yè)的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),生物醫(yī)療行業(yè)也不例外。“近年來(lái),生物醫(yī)療行業(yè)的海量數(shù)據(jù)迅速形成,但相對(duì)于國(guó)外大量開放鏈接數(shù)據(jù)集對(duì)生物醫(yī)藥領(lǐng)域研究的促進(jìn)發(fā)展,國(guó)內(nèi)的生物醫(yī)療行業(yè)數(shù)據(jù)封閉、分散且表示方式不一致,制約了整個(gè)行業(yè)的發(fā)展。”華東理工大學(xué)阮彤老師如是說(shuō)。

為此,華東理工大學(xué)信息學(xué)院攜手上海梅斯醫(yī)學(xué),在上海市經(jīng)濟(jì)與信息化委員會(huì)指導(dǎo)以及上海市大數(shù)據(jù)聯(lián)盟的支持下,成立了“生物醫(yī)藥開放鏈接大數(shù)據(jù)聯(lián)合研究中心”,旨在充分發(fā)揮雙方優(yōu)勢(shì),提供開放的中文基礎(chǔ)生物醫(yī)藥數(shù)據(jù),關(guān)聯(lián)國(guó)內(nèi)外已有的生物醫(yī)藥開放鏈接數(shù)據(jù),搭建生物醫(yī)療大數(shù)據(jù)研究公共服務(wù)平臺(tái),為生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)挖掘工作提供更多的支撐和服務(wù)。

2016年3月12日,由華東理工大學(xué)信息學(xué)院、梅斯醫(yī)學(xué)主辦,主題為“開放·鏈接·服務(wù)”的2016生物醫(yī)療大數(shù)據(jù)研討會(huì)暨華理-梅斯生物醫(yī)藥開放鏈接大數(shù)據(jù)研究中心成立儀式在華東理工大學(xué)舉行,標(biāo)志著全國(guó)首個(gè)生物醫(yī)療開放大數(shù)據(jù)研究中心落滬。

來(lái)自復(fù)旦大學(xué)、上海交通大學(xué)-耶魯大學(xué)聯(lián)合生物統(tǒng)計(jì)中心、中科院系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、曙光醫(yī)院、萬(wàn)達(dá)信息等高校、科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)療機(jī)構(gòu)和企業(yè)的300余位專家學(xué)者與會(huì),圍繞大數(shù)據(jù)開放與共享、數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián),大數(shù)據(jù)關(guān)鍵技術(shù)與大數(shù)據(jù)在生物醫(yī)藥行業(yè)應(yīng)用等話題展開研討。此外,研究中心還向參會(huì)代表贈(zèng)送了基于RDF(Resource Definition Framework)格式,關(guān)聯(lián)基因、藥品與疾病的約1個(gè)G的開放鏈接數(shù)據(jù)(Linked Open Data)集合。

華東理工大學(xué)副校長(zhǎng)劉昌勝表示,“醫(yī)療大數(shù)據(jù)與精準(zhǔn)醫(yī)療的聯(lián)姻,為實(shí)現(xiàn)健康醫(yī)療的精準(zhǔn)預(yù)防、精準(zhǔn)治療、精準(zhǔn)預(yù)后等提供了可行之路。”近年來(lái),生物醫(yī)療行業(yè)的海量數(shù)據(jù)迅速形成,同時(shí),伴隨著大數(shù)據(jù)處理關(guān)鍵技術(shù)的突破、數(shù)據(jù)開放等契機(jī)的發(fā)展,大數(shù)據(jù)將在促進(jìn)行業(yè)發(fā)展中發(fā)揮重要作用。

梅斯醫(yī)學(xué)董事長(zhǎng)張發(fā)寶認(rèn)為,當(dāng)前衛(wèi)生信息化建設(shè)的發(fā)展很快,與醫(yī)藥相關(guān)的行業(yè)數(shù)據(jù)正在以前所未有的速度增長(zhǎng),大數(shù)據(jù)應(yīng)用也已起步,開放醫(yī)藥大數(shù)據(jù)的研究已成為熱點(diǎn),一些國(guó)際著名大學(xué)著手成立大數(shù)據(jù)研究機(jī)構(gòu),但是,在數(shù)據(jù)利用、技術(shù)應(yīng)用等多方面仍然面臨諸多亟需解決的問(wèn)題。所以希望與華東理工大學(xué)信息學(xué)院的強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合,發(fā)揮各自優(yōu)勢(shì),搭建生物醫(yī)療大數(shù)據(jù)研究公共服務(wù)平臺(tái),為行業(yè)發(fā)展盡力。

據(jù)澎湃新聞(www.thepaper.cn)了解,生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)挖掘是生物醫(yī)藥與信息技術(shù)的交叉學(xué)科。在大數(shù)據(jù)挖掘方面,華東理工大學(xué)擁有計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)以及統(tǒng)計(jì)學(xué)等學(xué)科優(yōu)勢(shì),學(xué)生團(tuán)隊(duì)曾榮獲2014年百度知識(shí)圖譜數(shù)據(jù)分析競(jìng)賽一等獎(jiǎng),2015年百度大數(shù)據(jù)競(jìng)賽一等獎(jiǎng)及特別貢獻(xiàn)獎(jiǎng),并且在西班牙舉辦的2015年語(yǔ)言學(xué)鏈接開放數(shù)據(jù)競(jìng)賽中奪魁。目前華東理工大學(xué)正與曙光醫(yī)院、萬(wàn)達(dá)信息、上海申康合作,共同承擔(dān)國(guó)家863項(xiàng)目“心血管疾病與腫瘤疾病中西醫(yī)臨床大數(shù)據(jù)處理分析與應(yīng)用研究”。華東理工大學(xué)在生物醫(yī)藥的相關(guān)研究領(lǐng)域工作中也取得了一系列成果,在藥物化學(xué)領(lǐng)域頂級(jí)期刊——美國(guó)《藥物化學(xué)》雜志上發(fā)表的研究論文數(shù)量也領(lǐng)先于國(guó)內(nèi)其他高等院校。按論文發(fā)表數(shù)量衡量,在國(guó)際Top10研究機(jī)構(gòu)中,在“基于結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)”領(lǐng)域中與美國(guó)普渡大學(xué)并列第三。

上海梅斯醫(yī)藥科技有限公司作為國(guó)內(nèi)最大的醫(yī)藥生物和醫(yī)療健康產(chǎn)業(yè)服務(wù)平臺(tái),提供專業(yè)醫(yī)藥生物信息服務(wù)、臨床醫(yī)學(xué)研究協(xié)助服務(wù)、臨床研究成果轉(zhuǎn)化服務(wù)等。特別是在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有核心的資源,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有強(qiáng)大的學(xué)術(shù)團(tuán)隊(duì)。

據(jù)介紹,華理-梅斯生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)研究中心將從開放鏈接大數(shù)據(jù)和專注多元化開發(fā)模式等方面為進(jìn)一步推動(dòng)生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)的發(fā)展作出貢獻(xiàn)。

通過(guò)開放鏈接大數(shù)據(jù) 實(shí)現(xiàn)“開放·鏈接·服務(wù)”?;诨A(chǔ)知識(shí)圖譜、提供數(shù)據(jù)下載、瀏覽、查詢、問(wèn)答、語(yǔ)義標(biāo)注等技術(shù)服務(wù),并在此基礎(chǔ)上,提供電子病歷數(shù)據(jù)質(zhì)量檢測(cè)、疾病分類、藥品成分查詢等業(yè)務(wù)服務(wù)。為社會(huì)公眾提供健康指導(dǎo),為醫(yī)療與醫(yī)藥企業(yè)提供專業(yè)信息服務(wù)。在未來(lái)三年內(nèi)能為政府公共衛(wèi)生系統(tǒng)提供輔助決策咨詢服務(wù),為醫(yī)院、醫(yī)藥企業(yè)提供疾病知識(shí)庫(kù)、藥品知識(shí)庫(kù)等的查詢服務(wù)、輔助治療服務(wù)。通過(guò)共享、反饋,促進(jìn)知識(shí)庫(kù)的更新和發(fā)展,依托于上海大數(shù)據(jù)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新聯(lián)盟與中關(guān)村大數(shù)據(jù)聯(lián)盟,聯(lián)合各類醫(yī)療機(jī)構(gòu)與IT機(jī)構(gòu),形成生物醫(yī)藥開放大數(shù)據(jù)社區(qū),進(jìn)而逐步實(shí)現(xiàn)“開放·鏈接·服務(wù)”的服務(wù)理念。

專注多元化開發(fā)模式加速生物醫(yī)藥大數(shù)據(jù)創(chuàng)新。利用異構(gòu)數(shù)據(jù)抽取、整合、處理技術(shù),知識(shí)圖譜技術(shù),語(yǔ)義標(biāo)注技術(shù),醫(yī)藥大數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)的研究及算法并行化改造技術(shù),語(yǔ)義質(zhì)量控制技術(shù)等生物醫(yī)藥領(lǐng)域的關(guān)鍵技術(shù)展開研究。通過(guò)創(chuàng)新基地建設(shè),有效解決現(xiàn)有系統(tǒng)封閉、資源分散等問(wèn)題,大幅提升成果快速轉(zhuǎn)化擴(kuò)散能力。

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